Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PLNP26678 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PLNP26678 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLNP26678 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PLNP26678 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PLNP26678 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PLNP26678 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PLNP26678 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PLNP26678 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PLNP26678 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PLNP26678 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PLNP26678 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms