Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME1P15531 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME1P15531 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME1P15531 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NME1P15531 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME1P15531 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME1P15531 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NME1P15531 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
NME1P15531 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME1P15531 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME1P15531 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME1P15531 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME1P15531 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NME1P15531 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NME1P15531 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NME1P15531 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME1P15531 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME1P15531 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME1P15531 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NME1P15531 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NME1P15531 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NME1P15531 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NME1P15531 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME1P15531 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME1P15531 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME1P15531 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME1P15531 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME1P15531 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NME1P15531 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME1P15531 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME1P15531 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NME1P15531 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NME1P15531 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NME1P15531 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME1P15531 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME1P15531 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME1P15531 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms