Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPGDP15428 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPGDP15428 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HPGDP15428 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPGDP15428 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HPGDP15428 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HPGDP15428 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HPGDP15428 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPGDP15428 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HPGDP15428 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPGDP15428 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HPGDP15428 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HPGDP15428 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPGDP15428 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HPGDP15428 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPGDP15428 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HPGDP15428 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HPGDP15428 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPGDP15428 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HPGDP15428 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HPGDP15428 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HPGDP15428 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HPGDP15428 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HPGDP15428 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HPGDP15428 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HPGDP15428 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPGDP15428 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPGDP15428 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HPGDP15428 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPGDP15428 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HPGDP15428 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPGDP15428 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPGDP15428 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HPGDP15428 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HPGDP15428 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.7 ms