Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FCER1AP12319 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FCER1AP12319 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FCER1AP12319 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms