Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KRT16P08779 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KRT16P08779 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT16P08779 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT16P08779 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT16P08779 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT16P08779 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT16P08779 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT16P08779 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KRT16P08779 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT16P08779 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KRT16P08779 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KRT16P08779 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT16P08779 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT16P08779 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT16P08779 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT16P08779 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRT16P08779 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
KRT16P08779 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KRT16P08779 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRT16P08779 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT16P08779 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT16P08779 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT16P08779 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT16P08779 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT16P08779 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT16P08779 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRT16P08779 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRT16P08779 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KRT16P08779 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRT16P08779 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT16P08779 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT16P08779 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KRT16P08779 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms