Protein–RNA interactions for Protein: P04350

TUBB4A, Tubulin beta-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4AP04350 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TUBB4AP04350 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TUBB4AP04350 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TUBB4AP04350 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms