Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2P04141 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSF2P04141 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2P04141 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2P04141 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2P04141 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSF2P04141 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSF2P04141 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSF2P04141 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CSF2P04141 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSF2P04141 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2P04141 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2P04141 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2P04141 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2P04141 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2P04141 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2P04141 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSF2P04141 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2P04141 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2P04141 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2P04141 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2P04141 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSF2P04141 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSF2P04141 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2P04141 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2P04141 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2P04141 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSF2P04141 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2P04141 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2P04141 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2P04141 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSF2P04141 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2P04141 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2P04141 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSF2P04141 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF2P04141 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF2P04141 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF2P04141 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF2P04141 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSF2P04141 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF2P04141 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF2P04141 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF2P04141 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF2P04141 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF2P04141 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF2P04141 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CSF2P04141 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CSF2P04141 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CSF2P04141 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms