Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR1P03372 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR1P03372 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR1P03372 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR1P03372 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR1P03372 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ESR1P03372 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ESR1P03372 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ESR1P03372 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR1P03372 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR1P03372 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR1P03372 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ESR1P03372 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ESR1P03372 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ESR1P03372 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ESR1P03372 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESR1P03372 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESR1P03372 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESR1P03372 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ESR1P03372 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESR1P03372 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ESR1P03372 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ESR1P03372 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ESR1P03372 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ESR1P03372 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ESR1P03372 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESR1P03372 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESR1P03372 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESR1P03372 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESR1P03372 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESR1P03372 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ESR1P03372 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ESR1P03372 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ESR1P03372 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ESR1P03372 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESR1P03372 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESR1P03372 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESR1P03372 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESR1P03372 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ESR1P03372 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ESR1P03372 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms