Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DHX16O60231 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DHX16O60231 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DHX16O60231 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX16O60231 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX16O60231 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX16O60231 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX16O60231 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DHX16O60231 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DHX16O60231 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
DHX16O60231 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX16O60231 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX16O60231 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DHX16O60231 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX16O60231 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX16O60231 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX16O60231 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DHX16O60231 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DHX16O60231 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX16O60231 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX16O60231 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX16O60231 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX16O60231 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX16O60231 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DHX16O60231 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DHX16O60231 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DHX16O60231 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX16O60231 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX16O60231 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX16O60231 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DHX16O60231 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DHX16O60231 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DHX16O60231 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DHX16O60231 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX16O60231 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX16O60231 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX16O60231 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DHX16O60231 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DHX16O60231 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms