Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC11O43248 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC11O43248 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC11O43248 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms