Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PAXBP1Q9Y5B6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PAXBP1Q9Y5B6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PAXBP1Q9Y5B6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms