Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLF12Q9Y4X4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLF12Q9Y4X4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms