Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJP4

KLHL21, Kelch-like protein 21, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL21Q9UJP4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL21Q9UJP4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL21Q9UJP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL21Q9UJP4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms