Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
KDM5BQ9UGL1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
KDM5BQ9UGL1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
KDM5BQ9UGL1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
KDM5BQ9UGL1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms