Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC88CQ9P219 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC88CQ9P219 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC88CQ9P219 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1644.7 ms