Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KCMF1Q9P0J7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCMF1Q9P0J7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCMF1Q9P0J7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms