Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.439e-7■■■■■ 30.6
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FAM120AQ9NZB2 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 30.6
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FAM120AQ9NZB2 GNPTG-209ENST00000534197 420 ntTSL 324.23■■□□□ 1.475e-8■■■■■ 30.5
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FAM120AQ9NZB2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.172e-7■■■■■ 30.5
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FAM120AQ9NZB2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 30.4
FAM120AQ9NZB2 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 30.4
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FAM120AQ9NZB2 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 30.4
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FAM120AQ9NZB2 ARPC1B-213ENST00000458033 561 ntTSL 221.34■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 30.4
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FAM120AQ9NZB2 ARPC1B-207ENST00000431816 581 ntTSL 221.34■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 30.4
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FAM120AQ9NZB2 ARPC1B-205ENST00000427217 545 ntTSL 321.34■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 30.4
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FAM120AQ9NZB2 ACTN1-201ENST00000193403 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 30.4
FAM120AQ9NZB2 ACTN1-203ENST00000394419 3464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-6■■■■■ 30.4
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FAM120AQ9NZB2 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.458e-7■■■■■ 30.3
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FAM120AQ9NZB2 TMEM161B-AS1-201ENST00000496733 409 ntTSL 38.32□□□□□ -1.088e-7■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 TMEM161B-AS1-211ENST00000512724 570 ntTSL 35.1□□□□□ -1.598e-7■■■■■ 30.3
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FAM120AQ9NZB2 PITPNA-207ENST00000575288 1264 ntTSL 229.51■■■□□ 2.312e-7■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 PITPNA-211ENST00000576761 589 ntTSL 428.17■■■□□ 2.12e-7■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 PITPNA-209ENST00000576010 573 ntTSL 528.17■■■□□ 2.12e-7■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 PITPNA-205ENST00000573231 504 ntTSL 411.18□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 RGS12-224ENST00000514268 2751 ntTSL 520.25■□□□□ 0.831e-6■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 RGS12-219ENST00000511805 552 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 30.3
FAM120AQ9NZB2 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 30.2
FAM120AQ9NZB2 RAC2-205ENST00000441619 705 ntTSL 59.55□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 30.2
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.231e-6■■■■■ 30.2
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 30.2
FAM120AQ9NZB2 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 519.99■□□□□ 0.795e-8■■■■■ 30.2
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.272e-7■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 221.95■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.119e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 RAP2C-204ENST00000490400 215 ntTSL 218.3■□□□□ 0.529e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.339e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 RAP2C-203ENST00000460462 804 ntTSL 313.51□□□□□ -0.259e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 RAP2C-205ENST00000620646 3341 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.769e-8■■■■■ 30.1
FAM120AQ9NZB2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.562e-11■■■■■ 30.1
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