RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576010.6

PITPNA-209, Transcript of phosphatidylinositol transfer protein alpha, humanhuman

TSL 5

Gene PITPNA, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNA-209ENST00000576010 NISCHQ9Y2I1 1504 aa63.91■■■■■ 7.82
PITPNA-209ENST00000576010 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.18■■■■■ 6.74
PITPNA-209ENST00000576010 ABCC9O60706 1549 aa56.57■■■■■ 6.65
PITPNA-209ENST00000576010 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.15■■■■■ 6.26
PITPNA-209ENST00000576010 NACADO15069 1562 aa53.91■■■■■ 6.22
PITPNA-209ENST00000576010 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.67■■■■■ 6.18
PITPNA-209ENST00000576010 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.36■■■■■ 6.13
PITPNA-209ENST00000576010 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.08■■■■■ 6.09
PITPNA-209ENST00000576010 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.95■■■■■ 6.07
PITPNA-209ENST00000576010 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.86■■■■■ 6.05
PITPNA-209ENST00000576010 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.72■■■■■ 6.03
PITPNA-209ENST00000576010 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.53■■■■■ 6
PITPNA-209ENST00000576010 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.51■■■■■ 6
PITPNA-209ENST00000576010 SCRIBQ14160 1630 aa52.07■■■■■ 5.93
PITPNA-209ENST00000576010 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa51.92■■■■■ 5.9
PITPNA-209ENST00000576010 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.19■■■■■ 5.79
PITPNA-209ENST00000576010 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.16■■■■■ 5.78
PITPNA-209ENST00000576010 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.92■■■■■ 5.74
PITPNA-209ENST00000576010 SMARCA4P51532 1647 aa49.76■■■■■ 5.56
PITPNA-209ENST00000576010 NCAPD3P42695 1498 aa49.73■■■■■ 5.55
PITPNA-209ENST00000576010 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.64■■■■■ 5.54
PITPNA-209ENST00000576010 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.6■■■■■ 5.53
PITPNA-209ENST00000576010 SMARCA2P51531 1590 aa49.58■■■■■ 5.53
PITPNA-209ENST00000576010 HMGXB3Q12766 1538 aa49.44■■■■■ 5.51
PITPNA-209ENST00000576010 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.29■■■■■ 5.48
PITPNA-209ENST00000576010 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.22■■■■■ 5.47
PITPNA-209ENST00000576010 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.21■■■■■ 5.47
PITPNA-209ENST00000576010 ERCC6Q03468 1493 aa48.84■■■■■ 5.41
PITPNA-209ENST00000576010 NESP48681 1621 aa48.74■■■■■ 5.39
PITPNA-209ENST00000576010 WIZO95785 1651 aa48.69■■■■■ 5.39
PITPNA-209ENST00000576010 CUX2O14529 1486 aa48.59■■■■■ 5.37
PITPNA-209ENST00000576010 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.56■■■■■ 5.36
PITPNA-209ENST00000576010 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.41■■■■■ 5.34
PITPNA-209ENST00000576010 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.24■■■■■ 5.31
PITPNA-209ENST00000576010 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.24■■■■■ 5.31
PITPNA-209ENST00000576010 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.21■■■■■ 5.31
PITPNA-209ENST00000576010 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.19■■■■■ 5.31
PITPNA-209ENST00000576010 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
PITPNA-209ENST00000576010 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.9■■■■■ 5.26
PITPNA-209ENST00000576010 CFTRP13569 1480 aa47.81■■■■■ 5.24
PITPNA-209ENST00000576010 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.78■■■■■ 5.24
PITPNA-209ENST00000576010 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.71■■■■■ 5.23
PITPNA-209ENST00000576010 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.7■■■■■ 5.23
PITPNA-209ENST00000576010 WDR62O43379 1518 aa47.66■■■■■ 5.22
PITPNA-209ENST00000576010 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.54■■■■■ 5.2
PITPNA-209ENST00000576010 PRDM2Q13029 1718 aa47.48■■■■■ 5.19
PITPNA-209ENST00000576010 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.25■■■■■ 5.16
PITPNA-209ENST00000576010 TOPBP1Q92547 1522 aa46.85■■■■■ 5.09
PITPNA-209ENST00000576010 ABCC8Q09428 1581 aa46.84■■■■■ 5.09
PITPNA-209ENST00000576010 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.75■■■■■ 5.07
PITPNA-209ENST00000576010 IFT140Q96RY7 1462 aa46.74■■■■■ 5.07
PITPNA-209ENST00000576010 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
PITPNA-209ENST00000576010 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.56■■■■■ 5.04
PITPNA-209ENST00000576010 OSCARQ8IYS5 282 aa46.43■■■■■ 5.02
PITPNA-209ENST00000576010 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.41■■■■■ 5.02
PITPNA-209ENST00000576010 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.4■■■■■ 5.02
PITPNA-209ENST00000576010 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.39■■■■■ 5.02
PITPNA-209ENST00000576010 CUX1P39880 1505 aa46.23■■■■■ 4.99
PITPNA-209ENST00000576010 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.21■■■■■ 4.99
PITPNA-209ENST00000576010 SOGA1O94964 1423 aa46.2■■■■■ 4.99
PITPNA-209ENST00000576010 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.2■■■■■ 4.99
PITPNA-209ENST00000576010 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.19■■■■■ 4.99
PITPNA-209ENST00000576010 WDR97A6NE52 1622 aa46.03■■■■■ 4.96
PITPNA-209ENST00000576010 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.01■■■■■ 4.96
PITPNA-209ENST00000576010 TRIM41Q8WV44 630 aa46.01■■■■■ 4.96
PITPNA-209ENST00000576010 CHD1O14646 1710 aa45.97■■■■■ 4.95
PITPNA-209ENST00000576010 FBLN2P98095 1184 aa45.81■■■■■ 4.92
PITPNA-209ENST00000576010 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.78■■■■■ 4.92
PITPNA-209ENST00000576010 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.78■■■■■ 4.92
PITPNA-209ENST00000576010 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.78■■■■■ 4.92
PITPNA-209ENST00000576010 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.78■■■■■ 4.92
PITPNA-209ENST00000576010 GRIN2BQ13224 1484 aa45.75■■■■■ 4.91
PITPNA-209ENST00000576010 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.72■■■■■ 4.91
PITPNA-209ENST00000576010 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.71■■■■■ 4.91
PITPNA-209ENST00000576010 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.69■■■■■ 4.9
PITPNA-209ENST00000576010 ARHGEF11O15085 1522 aa45.68■■■■■ 4.9
PITPNA-209ENST00000576010 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.68■■■■■ 4.94e-6■■■■□ 21.5
PITPNA-209ENST00000576010 TOP2BQ02880 1626 aa45.67■■■■■ 4.9
PITPNA-209ENST00000576010 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.66■■■■■ 4.9
PITPNA-209ENST00000576010 PBRM1Q86U86 1689 aa45.66■■■■■ 4.9
PITPNA-209ENST00000576010 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.61■■■■■ 4.89
PITPNA-209ENST00000576010 SYNJ1O43426 1573 aa45.61■■■■■ 4.89
PITPNA-209ENST00000576010 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.58■■■■■ 4.89
PITPNA-209ENST00000576010 SYNJ2O15056 1496 aa45.55■■■■■ 4.88
PITPNA-209ENST00000576010 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.42■■■■■ 4.86
PITPNA-209ENST00000576010 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.28■■■■■ 4.84
PITPNA-209ENST00000576010 ARAP1Q96P48 1450 aa45.25■■■■■ 4.83
PITPNA-209ENST00000576010 ADAMTS12P58397 1594 aa45.21■■■■■ 4.83
PITPNA-209ENST00000576010 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.17■■■■■ 4.82
PITPNA-209ENST00000576010 GRIN2AQ12879 1464 aa45.17■■■■■ 4.82
PITPNA-209ENST00000576010 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.1■■■■■ 4.81
PITPNA-209ENST00000576010 NUP160Q12769 1436 aa44.98■■■■■ 4.79
PITPNA-209ENST00000576010 CEP170Q5SW79 1584 aa44.98■■■■■ 4.79
PITPNA-209ENST00000576010 KIF27Q86VH2 1401 aa44.78■■■■■ 4.76
PITPNA-209ENST00000576010 SHROOM2Q13796 1616 aa44.76■■■■■ 4.76
PITPNA-209ENST00000576010 ERCC6L2Q5T890 1561 aa44.71■■■■■ 4.75
PITPNA-209ENST00000576010 IGF1RP08069 1367 aa44.67■■■■■ 4.74
PITPNA-209ENST00000576010 CUL7Q14999 1698 aa44.65■■■■■ 4.74
PITPNA-209ENST00000576010 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.74
PITPNA-209ENST00000576010 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.57■■■■■ 4.73
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