Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.243e-18■■■■■ 239.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-208ENST00000454619 719 ntTSL 515.93■□□□□ 0.142e-18■■■■■ 201.2
FAM120AQ9NZB2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.372e-18■■■■■ 196.6
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.35e-9■■■■■ 191.6
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.295e-9■■■■■ 191.6
FAM120AQ9NZB2 NME4-204ENST00000433358 966 ntTSL 325.41■■□□□ 1.664e-18■■■■■ 191.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-209ENST00000460297 1652 ntTSL 525.25■■□□□ 1.634e-18■■■■■ 191.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-206ENST00000448828 1167 ntTSL 224.69■■□□□ 1.543e-18■■■■■ 191.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.374e-18■■■■■ 191.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.373e-18■■■■■ 191.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-205ENST00000444498 1111 ntTSL 320.27■□□□□ 0.843e-18■■■■■ 191.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.653e-18■■■■■ 191.3
FAM120AQ9NZB2 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.053e-18■■■■■ 190.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 410.49□□□□□ -0.736e-21■■■■■ 187
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 150
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.6■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 150
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.6■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 150
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.61■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 150
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 150
FAM120AQ9NZB2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 150
FAM120AQ9NZB2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 132.7
FAM120AQ9NZB2 FAM98B-204ENST00000559431 305 ntTSL 511.19□□□□□ -0.628e-17■■■■■ 132.7
FAM120AQ9NZB2 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.248e-7■■■■■ 131.6
FAM120AQ9NZB2 PCSK6-212ENST00000560785 507 ntTSL 413.72□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 131.6
FAM120AQ9NZB2 PCSK6-205ENST00000558433 543 ntTSL 413.55□□□□□ -0.248e-7■■■■■ 131.6
FAM120AQ9NZB2 PCSK6-207ENST00000558951 543 ntTSL 310.46□□□□□ -0.738e-7■■■■■ 131.6
FAM120AQ9NZB2 PCSK6-206ENST00000558864 3868 ntTSL 27.37□□□□□ -1.238e-7■■■■■ 131.6
FAM120AQ9NZB2 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.918e-57■■■■■ 126.9
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-209ENST00000499370 2164 ntTSL 211.91□□□□□ -0.56e-9■■■■■ 123.2
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-208ENST00000496851 881 ntTSL 510.39□□□□□ -0.756e-9■■■■■ 123.2
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.98e-70■■■■■ 122.3
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-211ENST00000427603 526 ntTSL 410.27□□□□□ -0.778e-70■■■■■ 122.3
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-220ENST00000627726 3135 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.848e-70■■■■■ 122.3
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.118e-70■■■■■ 122.3
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.218e-70■■■■■ 122.3
FAM120AQ9NZB2 PCSK6-202ENST00000398185 3723 ntTSL 1 (best)9.6□□□□□ -0.871e-6■■■■■ 120.5
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 218.71■□□□□ 0.599e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 516.39■□□□□ 0.219e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.29e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 215.93■□□□□ 0.149e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.149e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 214.97□□□□□ -0.019e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)14.06□□□□□ -0.169e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 29.31□□□□□ -0.929e-10■■■■■ 113.6
FAM120AQ9NZB2 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.191e-51■■■■■ 113
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.837e-8■■■■■ 101.3
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 217.28■□□□□ 0.367e-8■■■■■ 101.3
FAM120AQ9NZB2 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 221.57■■□□□ 1.045e-8■■■■■ 96.4
FAM120AQ9NZB2 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 420.6■□□□□ 0.895e-8■■■■■ 96.4
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.77e-8■■■■■ 95.9
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.077e-8■■■■■ 95.9
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.067e-8■■■■■ 95.9
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 221.25■□□□□ 0.997e-8■■■■■ 95.9
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 519.41■□□□□ 0.77e-8■■■■■ 95.9
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 519.37■□□□□ 0.697e-8■■■■■ 95.9
FAM120AQ9NZB2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.447e-8■■■■■ 95.9
FAM120AQ9NZB2 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.597e-8■■■■■ 90.8
FAM120AQ9NZB2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.875e-18■■■■■ 90.4
FAM120AQ9NZB2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.365e-18■■■■■ 90.4
FAM120AQ9NZB2 KCTD15-205ENST00000588637 571 ntTSL 519.3■□□□□ 0.685e-18■■■■■ 90.4
FAM120AQ9NZB2 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 317.43■□□□□ 0.385e-18■■■■■ 90.4
FAM120AQ9NZB2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-18■■■■■ 90.4
FAM120AQ9NZB2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.155e-17■■■■■ 89.8
FAM120AQ9NZB2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.075e-17■■■■■ 89.8
FAM120AQ9NZB2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.045e-17■■■■■ 89.8
FAM120AQ9NZB2 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.75e-17■■■■■ 89.8
FAM120AQ9NZB2 FTCD-210ENST00000488577 447 ntTSL 320.99■□□□□ 0.953e-12■■■■■ 89.6
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-202ENST00000586123 574 ntTSL 426.22■■□□□ 1.793e-11■■■■■ 88.8
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-205ENST00000587467 646 ntTSL 224.49■■□□□ 1.513e-11■■■■■ 88.8
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-208ENST00000588358 642 ntTSL 224.33■■□□□ 1.493e-11■■■■■ 88.8
FAM120AQ9NZB2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.132e-15■■■■■ 84.8
FAM120AQ9NZB2 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)22.27■■□□□ 1.169e-37■■■■■ 83.1
FAM120AQ9NZB2 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.569e-37■■■■■ 83.1
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-203ENST00000587195 571 ntTSL 424.33■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 80.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.422e-8■■■■■ 80.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.242e-8■■■■■ 80.5
FAM120AQ9NZB2 ZNF444-206ENST00000587664 568 ntTSL 321.67■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 80.5
FAM120AQ9NZB2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.722e-10■■■■■ 80.1
FAM120AQ9NZB2 B3GNTL1-210ENST00000573629 423 ntTSL 310.18□□□□□ -0.783e-14■■■■■ 77.6
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.75e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.525e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.355e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.975e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.985e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.985e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.075e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.56□□□□□ -1.365e-37■■■■■ 76.5
FAM120AQ9NZB2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.632e-22■■■■■ 76.2
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)24.44■■□□□ 1.53e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-207ENST00000445633 1733 ntTSL 1 (best)24.44■■□□□ 1.53e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.453e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.433e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.723e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-208ENST00000452531 1011 ntTSL 519.48■□□□□ 0.713e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-215ENST00000496767 779 ntTSL 516.33■□□□□ 0.23e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-206ENST00000422701 636 ntTSL 316.25■□□□□ 0.193e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.073e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 315.08■□□□□ 03e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 PFKFB4-203ENST00000412035 567 ntTSL 414.1□□□□□ -0.153e-22■■■■■ 75.3
FAM120AQ9NZB2 STXBP2-205ENST00000593854 704 ntTSL 220.05■□□□□ 0.88e-8■■■■■ 75
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 50.3 ms