Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RDH8Q9NYR8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RDH8Q9NYR8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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