Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FSCN3Q9NQT6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FSCN3Q9NQT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FSCN3Q9NQT6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms