Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTN4Q9HB63 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTN4Q9HB63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTN4Q9HB63 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTN4Q9HB63 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NTN4Q9HB63 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTN4Q9HB63 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NTN4Q9HB63 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms