Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SHARPINQ9H0F6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SHARPINQ9H0F6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SHARPINQ9H0F6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms