Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ8

MAP1LC3B, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3BQ9GZQ8 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MAP1LC3BQ9GZQ8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MAP1LC3BQ9GZQ8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms