Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SMIM3Q9BZL3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMIM3Q9BZL3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMIM3Q9BZL3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms