Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SNHG12Q9BXW3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNHG12Q9BXW3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms