Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VN1R3Q9BXE9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VN1R3Q9BXE9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R3Q9BXE9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms