Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
ARXQ96QS3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARXQ96QS3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ARXQ96QS3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.2 ms