Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ZNF560Q96MR9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF560Q96MR9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ZNF560Q96MR9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms