Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TTC9Q92623 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TTC9Q92623 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC9Q92623 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms