Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW78

UQCC3, Ubiquinol-cytochrome-c reductase complex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCC3Q6UW78 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
UQCC3Q6UW78 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
UQCC3Q6UW78 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms