Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC137Q6PK04 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CCDC137Q6PK04 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC137Q6PK04 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms