Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TTC27Q6P3X3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TTC27Q6P3X3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TTC27Q6P3X3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms