Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWQ0

RSBN1, Round spermatid basic protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSBN1Q5VWQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RSBN1Q5VWQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RSBN1Q5VWQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms