Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf135Q5VTT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
C9orf135Q5VTT2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
C9orf135Q5VTT2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms