Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TNNI3KQ59H18 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TNNI3KQ59H18 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TNNI3KQ59H18 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms