Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PGS1Q32NB8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGS1Q32NB8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms