Protein–RNA interactions for Protein: Q2MV58

TCTN1, Tectonic-1, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTN1Q2MV58 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCTN1Q2MV58 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCTN1Q2MV58 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCTN1Q2MV58 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TCTN1Q2MV58 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms