Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JMJD1CQ15652 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
JMJD1CQ15652 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
JMJD1CQ15652 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
JMJD1CQ15652 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
JMJD1CQ15652 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms