Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NR1D2Q14995 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NR1D2Q14995 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NR1D2Q14995 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms