Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.514e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-211ENST00000598240 3235 ntTSL 211.72□□□□□ -0.534e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.584e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-209ENST00000597280 814 ntTSL 38.61□□□□□ -1.034e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-204ENST00000593795 747 ntTSL 58.48□□□□□ -1.054e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-206ENST00000594773 4169 ntTSL 28.12□□□□□ -1.114e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 SUGP2-201ENST00000330854 3629 ntTSL 1 (best)7.31□□□□□ -1.244e-7■■□□□ 13.6
SRSF9Q13242 CHRD-207ENST00000459711 503 ntTSL 212.37□□□□□ -0.438e-9■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 APOB-201ENST00000233242 14121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.254e-7■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 SEMA4G-207ENST00000518244 652 ntTSL 312.84□□□□□ -0.359e-14■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 SEMA4G-209ENST00000519649 2024 ntTSL 511.55□□□□□ -0.569e-14■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 SEMA4G-206ENST00000518124 596 ntTSL 311.09□□□□□ -0.639e-14■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 SEMA4G-211ENST00000521006 4656 ntTSL 1 (best)10.91□□□□□ -0.669e-14■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.196e-7■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 SLCO4A1-208ENST00000497209 3092 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.556e-7■■□□□ 13.5
SRSF9Q13242 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.118e-8■■□□□ 13.4
SRSF9Q13242 ASPSCR1-219ENST00000584454 1919 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.088e-8■■□□□ 13.4
SRSF9Q13242 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.028e-8■■□□□ 13.4
SRSF9Q13242 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.048e-8■■□□□ 13.4
SRSF9Q13242 ASPSCR1-213ENST00000582355 1246 ntTSL 514.57□□□□□ -0.088e-8■■□□□ 13.4
SRSF9Q13242 COL18A1-206ENST00000459895 588 ntTSL 37.81□□□□□ -1.161e-6■■□□□ 13.4
SRSF9Q13242 ANKRD11-202ENST00000330736 8342 ntTSL 512.15□□□□□ -0.462e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.347e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.47e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.617e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.047e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 28.31□□□□□ -1.087e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 AKAP1-212ENST00000573326 1580 ntTSL 58.06□□□□□ -1.127e-10■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 LUC7L3-205ENST00000504065 1071 ntTSL 54.29□□□□□ -1.727e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 LUC7L3-216ENST00000509487 647 ntTSL 32.92□□□□□ -1.947e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.093e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.23e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 SRRM2-218ENST00000574331 1759 ntTSL 212.56□□□□□ -0.43e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 SRRM2-221ENST00000574866 638 ntTSL 311.43□□□□□ -0.583e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 SRRM2-228ENST00000576878 1141 ntTSL 210.69□□□□□ -0.73e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.713e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 SRRM2-220ENST00000574593 1440 ntTSL 39.73□□□□□ -0.853e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.893e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.953e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 ZNF69-201ENST00000340180 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.363e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 ZNF69-202ENST00000429654 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.423e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 ZNF69-203ENST00000445911 569 ntTSL 26.03□□□□□ -1.443e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 34.5□□□□□ -1.691e-6■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.677e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.97e-7■■□□□ 13.3
SRSF9Q13242 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.79e-7■■□□□ 13.2
SRSF9Q13242 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.899e-7■■□□□ 13.2
SRSF9Q13242 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.469e-7■■□□□ 13.2
SRSF9Q13242 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 13.2
SRSF9Q13242 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 38.92□□□□□ -0.982e-7■■□□□ 13.2
SRSF9Q13242 CCDC144NL-AS1-201ENST00000417232 709 ntTSL 33.91□□□□□ -1.782e-7■■□□□ 13.2
SRSF9Q13242 HNRNPA2B1-206ENST00000490912 5328 ntTSL 212.44□□□□□ -0.421e-9■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 HNRNPA2B1-204ENST00000463181 6284 ntTSL 212.04□□□□□ -0.481e-9■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 HNRNPA2B1-203ENST00000360787 1724 ntTSL 511.04□□□□□ -0.641e-9■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 HNRNPA2B1-208ENST00000618183 3539 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.081e-9■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 HNRNPA2B1-202ENST00000356674 1711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.161e-9■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 HNRNPA2B1-201ENST00000354667 3664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.411e-9■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.055e-7■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 ANKRD11-205ENST00000562194 618 ntTSL 39.96□□□□□ -0.822e-7■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.056e-8■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 ZNF217-202ENST00000371471 5796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.076e-8■■□□□ 13.1
SRSF9Q13242 AL355987.4-202ENST00000459985 1900 ntTSL 216.38■□□□□ 0.212e-13■■□□□ 13
SRSF9Q13242 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.16e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.066e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.096e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.466e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.516e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MPG-202ENST00000356432 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.526e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.566e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.586e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 PCED1A-204ENST00000448755 1170 ntTSL 311.41□□□□□ -0.586e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.596e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.646e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MPG-204ENST00000436333 884 ntTSL 210.5□□□□□ -0.736e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MRPS25-204ENST00000447299 723 ntTSL 310.05□□□□□ -0.86e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 PCED1A-203ENST00000439542 1187 ntTSL 29.79□□□□□ -0.846e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MRPS25-201ENST00000253686 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.936e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.966e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC8.7□□□□□ -1.026e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RCC1-204ENST00000398958 2715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.041e-10■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RCC1-210ENST00000434290 1070 ntTSL 58.45□□□□□ -1.061e-10■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RCC1-207ENST00000427469 903 ntTSL 58.09□□□□□ -1.111e-10■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RCC1-203ENST00000373833 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.171e-10■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MRPS25-202ENST00000420267 590 ntTSL 47.66□□□□□ -1.186e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 SNHG3-201ENST00000413987 2201 ntTSL 1 (best)7.21□□□□□ -1.251e-10■■□□□ 13
SRSF9Q13242 UBE3C-203ENST00000430750 448 ntTSL 46.8□□□□□ -1.326e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 MRPS25-205ENST00000449354 1119 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.416e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 RBPMS-206ENST00000519359 839 ntTSL 54.97□□□□□ -1.616e-7■■□□□ 13
SRSF9Q13242 SNHG3-203ENST00000447507 185 ntTSL 1 (best)0.68□□□□□ -2.31e-10■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-208ENST00000563428 2531 ntTSL 212.13□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-217ENST00000566903 2628 ntTSL 511.62□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-204ENST00000544090 2747 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-212ENST00000564774 4637 ntTSL 211.29□□□□□ -0.62e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.922e-6■■□□□ 13
SRSF9Q13242 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.962e-6■■□□□ 13
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