Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	ARO10	YDR380W	1908 nt		6	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	YDR396W	YDR396W	501 nt		6	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	CLP1	YOR250C	1338 nt		5.99	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	GAL10	YBR019C	2100 nt		5.99	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	HFI1	YPL254W	1467 nt		5.99	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	BNA5	YLR231C	1362 nt		5.99	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	HEM3	YDL205C	984 nt		5.99	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	FOB1	YDR110W	1701 nt		5.99	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	HXT3	YDR345C	1704 nt		5.99	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	QDR1	YIL120W	1692 nt		5.98	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	AIM17	YHL021C	1398 nt		5.98	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	CDC10	YCR002C	969 nt		5.98	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	MND2	YIR025W	1107 nt		5.98	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	PHO86	YJL117W	936 nt		5.98	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	JJJ3	YJR097W	519 nt		5.98	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	HOR7	YMR251W-A	180 nt		5.98	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	VCX1	YDL128W	1236 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	GLO2	YDR272W	825 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	RRP45	YDR280W	918 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	CWC21	YDR482C	408 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	GUS1	YGL245W	2127 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	tR(ACG)J	tR(ACG)J	73 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	CBT1	YKL208W	816 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	ATG20	YDL113C	1923 nt		5.97	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	UTP9	YHR196W	1728 nt		5.96	□□□□□ -1.45
MRD1	Q06106	AVT3	YKL146W	2079 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	TRP1	YDR007W	675 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	tX(XXX)D	tX(XXX)D	100 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	MPM1	YJL066C	759 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	BUD28	YLR062C	378 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	snR32	snR32	188 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	DCC1	YCL016C	1143 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	HOS1	YPR068C	1413 nt		5.96	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	CCZ1	YBR131W	2115 nt		5.95	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	SMF3	YLR034C	1422 nt		5.95	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YNL019C	YNL019C	855 nt		5.95	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YNL033W	YNL033W	855 nt		5.95	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	APJ1	YNL077W	1587 nt		5.95	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	KIP2	YPL155C	2121 nt		5.95	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	PDH1	YPR002W	1551 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	VAM7	YGL212W	951 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YJU2	YKL095W	837 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	BUD14	YAR014C	2130 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YNL108C	YNL108C	813 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	LEM3	YNL323W	1245 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	UBA1	YKL210W	3075 nt		5.94	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	RPN12	YFR052W	825 nt		5.93	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	PRE7	YBL041W	726 nt		5.93	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YNR042W	YNR042W	429 nt		5.93	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	RET1	YOR207C	3450 nt		5.93	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	HPF1	YOL155C	2904 nt		5.93	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	ATG18	YFR021W	1503 nt		5.93	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	RAD53	YPL153C	2466 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	ACS2	YLR153C	2052 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	RFA1	YAR007C	1866 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	RAT1	YOR048C	3021 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	FET3	YMR058W	1911 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	PWP1	YLR196W	1731 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	UTR4	YEL038W	684 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	COS6	YGR295C	1146 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	STE50	YCL032W	1041 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	NOP7	YGR103W	1818 nt		5.92	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	GDB1	YPR184W	4611 nt		5.91	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YDR053W	YDR053W	396 nt		5.91	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	RPA49	YNL248C	1248 nt		5.91	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	NRM1	YNR009W	750 nt		5.91	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	ENV9	YOR246C	993 nt		5.91	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	SCO1	YBR037C	888 nt		5.91	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	VMA13	YPR036W	1437 nt		5.91	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	PHM8	YER037W	966 nt		5.9	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	YMR010W	YMR010W	1218 nt		5.9	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	ECM2	YBR065C	1095 nt		5.9	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	MRL1	YPR079W	1146 nt		5.9	□□□□□ -1.46
MRD1	Q06106	GCS1	YDL226C	1059 nt		5.89	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	COX17	YLL009C	210 nt		5.89	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	RPL21B	YPL079W	483 nt		5.89	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	ECM7	YLR443W	1347 nt		5.89	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	BRF1	YGR246C	1791 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	MNN2	YBR015C	1794 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	MSH1	YHR120W	2880 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	SNF11	YDR073W	510 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	MNN10	YDR245W	1182 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	RPB4	YJL140W	666 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	APN1	YKL114C	1104 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	YNL296W	YNL296W	315 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	RRN3	YKL125W	1884 nt		5.88	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	YNL095C	YNL095C	1929 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	NAG1	YGR031C-A	492 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	YJL193W	YJL193W	1209 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	TAF11	YML015C	1041 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	RDL1	YOR285W	420 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	RPT4	YOR259C	1314 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	TUB2	YFL037W	1374 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	VAN1	YML115C	1608 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	PRP40	YKL012W	1752 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	VTC2	YFL004W	2487 nt		5.87	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	HAP1	YLR256W	4509 nt		5.86	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	FOL1	YNL256W	2475 nt		5.86	□□□□□ -1.47
MRD1	Q06106	SSZ1	YHR064C	1617 nt		5.86	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.2 ms