Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL6Q02878 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RPL6Q02878 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPL6Q02878 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms