Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPL23P62829 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPL23P62829 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL23P62829 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL23P62829 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPL23P62829 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL23P62829 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL23P62829 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL23P62829 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL23P62829 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPL23P62829 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RPL23P62829 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RPL23P62829 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RPL23P62829 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RPL23P62829 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL23P62829 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL23P62829 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL23P62829 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RPL23P62829 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RPL23P62829 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms