Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVS71-1P61550 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVS71-1P61550 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVS71-1P61550 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms