Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PROK1P58294 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PROK1P58294 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PROK1P58294 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PROK1P58294 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PROK1P58294 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PROK1P58294 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PROK1P58294 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PROK1P58294 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PROK1P58294 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PROK1P58294 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PROK1P58294 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PROK1P58294 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PROK1P58294 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PROK1P58294 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PROK1P58294 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PROK1P58294 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PROK1P58294 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PROK1P58294 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PROK1P58294 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms