Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RAD23AP54725 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD23AP54725 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.6 ms