Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
UTRNP46939 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UTRNP46939 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UTRNP46939 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UTRNP46939 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
UTRNP46939 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
UTRNP46939 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UTRNP46939 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UTRNP46939 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
UTRNP46939 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UTRNP46939 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
UTRNP46939 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
UTRNP46939 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UTRNP46939 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UTRNP46939 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UTRNP46939 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UTRNP46939 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UTRNP46939 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
UTRNP46939 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UTRNP46939 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
UTRNP46939 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
UTRNP46939 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UTRNP46939 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
UTRNP46939 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
UTRNP46939 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UTRNP46939 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UTRNP46939 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UTRNP46939 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
UTRNP46939 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UTRNP46939 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
UTRNP46939 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UTRNP46939 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UTRNP46939 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UTRNP46939 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UTRNP46939 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UTRNP46939 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UTRNP46939 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UTRNP46939 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UTRNP46939 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
UTRNP46939 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UTRNP46939 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
UTRNP46939 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
UTRNP46939 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
UTRNP46939 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UTRNP46939 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UTRNP46939 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms