Protein–RNA interactions for Protein: P38919

EIF4A3, Eukaryotic initiation factor 4A-III, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A3P38919 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EIF4A3P38919 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EIF4A3P38919 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EIF4A3P38919 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms