Protein–RNA interactions for Protein: P30825

SLC7A1, High affinity cationic amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A1P30825 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC7A1P30825 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC7A1P30825 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC7A1P30825 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms